DyAFor - Dynamique et Assemblage des Forêts Tropicales

Mots clés
Ecologie des communautés
Ecologie fonctionnelle
Dynamique forestière

Comprendre la dynamique et l’assemblage des communautés d’arbres des forêts tropicales, afin de prédire leur évolution sous différents scénarios de changement global.

En s’appuyant sur une diversité d’outils (e.g. écophysiologie, génomique, télédétection, modélisation) et des contextes environnementaux et anthropiques variés dans l’ensemble des tropiques, nos travaux permettent de comprendre les mécanismes qui contrôlent la variabilité dans le temps et l’espace de la diversité, la structure, et du fonctionnement des forêts tropicales.
Trois approches complémentaires sont mobilisées pour répondre à cet objectif: i) la mise en place d’expériences, qui visent à contrôler de manière empirique des variables ou processus d’intérêts pour en comprendre les effets; ii) la collecte d’observations de terrain, qui visent à extraire des informations sur les processus à l’aide d’outils statistiques ; iii) le développement de modèles, qui visent à reproduire les processus et leur interactions en s’appuyant sur nos connaissances actuelles. En intégrant ces trois grandes familles d’approches, nous contribuons à identifier les échelles spatiales et temporelles auxquelles les processus écologiques et évolutifs qui contrôlent la dynamique et l’assemblage des forêts tropicales agissent et interagissent. Nos travaux se focalisent principalement sur les plantes, mais peuvent intégrer aussi d’autres niveaux trophiques (e.g. herbivores et micro-organismes) ayant un rôle clé dans certains processus, tels que le maintien de la diversité locale par densité dépendance négative ou les flux de carbone et nutriments par décomposition. Le développement des connaissances ainsi générées contribue à améliorer notre capacité à prédire le devenir des forêts tropicales dans un contexte de pression anthropique et de stress climatique grandissants.

Nos travaux s’appuient sur plusieurs chantiers d’investigation à travers les régions tropicales, en Amérique du Sud (Guyane française, Pérou, Equateur), Afrique centrale (Cameroun, Gabon, Congo, Sao Tomé et République Démocratique du Congo), Asie (Inde et Thaïlande) et Pacifique (Nouvelle Calédonie), ouvrant ainsi des perspectives de synthèses régionales et de comparaisons intercontinentales. Dans chacun de ces chantiers, nous nous appuyons notamment sur des réseaux de parcelles permanentes de suivi forestier, installées et suivies par nous-même et nos collaborateurs, en Guyane (Guyadiv), en Afrique centrale (Africadiv) et en Nouvelle-Calédonie (NC-PIPPN). Ces réseaux représentent c. 850 parcelles de 100 m2 à 1 ha et c. 200 000 arbres inventoriés. Les données de grands réseaux internationaux, tels que l’Amazon Tree Diversity Network ou ForestGeo, sont également mobilisés pour certaines études. Certains chantiers bénéficient de dispositifs structurants de recherches, tels que le LabEx CEBA en Guyane française, le LMI BioInca en Equateur et en Colombie, ou le LMI DYCOFAC en Afrique centrale. Les participants de notre thème se rendent régulièrement sur le terrain en missions mais aussi en expatriations, assurant donc la pérennité des dispositifs de recherches et des collaborations locales.

Acronyme Intitulé Durée
ADMIREPartenariat pour l’Analyse des DynaMIques de REforestation et de la résilience forestière (ADMIRE)
Porteur : Philippe BIRNBAUM 
2021 - 2024
AFRIFIREDéterminants et impacts du régime des feux en Afrique tropicale
Porteurs : Charly FAVIER (ISEM)  / Maxime REJOU-MECHAIN 
2021 - 2022
CartoDiv-DendroLidarReconnaissance spécifique et cartographie des arbres de la canopée en forêt tropicale ET télédétection individu centrée pour l'évaluation de la ressource en bois d'œuvre en Guyane française
Porteur : Grégoire VINCENT 
2017 - 2021
DeepRootInto the deep: exploring root distribution and function in tropical forests.
Porteurs : Claire FORTUNEL / Isabelle MARECHAUX 
2019 - 2021
DESSFORDegraded Stable States in Tropical Forests
Porteur : Maxime REJOU-MECHAIN 
2021 - 2024
DREAMDrought recovery mechanisms in a tropical forest
Porteur : Megan BARTLETT (University of California Davis)  
2019 - 2021
ELFRole of local evolutionary history on tropical forest diversity and functioning
Porteurs : Imma OLIVERAS (University of Oxford)  / Claire FORTUNEL 
2021 - 2021
INTRACOUnravelling the role of intraspecific variability in tree species coexistence in tropical forest
Porteurs : Ghislain VIEILLEDENT / Isabelle MARECHAUX 
2020 - 2022
ISLETSIsland leaf economics trait synthesis
Porteurs : Kasey BARTON (University of Hawaiʻi at Mānoa)  / Claire FORTUNEL 
2021 - 2022
Leaf and wood dimensionsLeaf and wood dimensions: Understanding topical forest diversity by integrating data and mechanistic models
Porteurs : Claire FORTUNEL / Caroline FARRIOR (UTA)  
2019 - 2021
ManagForResEffet de la gestion forestière sur la réponse des écosystèmes forestiers guyanais aux changements climatiques
Porteur : Géraldine DERROIRE (CIRAD, ECOFOG)  
2020 - 2022
METRADICAMechanistic traits to predict shifts in tree species abundance and distribution with climate change in the Amazonian forest
Porteurs : Ghislain VIEILLEDENT / Clément STAHL (INRAE, ECOFOG)  
2020 - 2022
PEPINOHistorical genomics of long-term PEople-Palm Interactions in the NeotrOpics
Porteurs : Louise BROUSSEAU / Guillaume ODONNE (CNRS, UMSR LEEISA)  
2019 - 2021
PhenobsTowards a phenology observatory in French Guiana to study climate-vegetation feedbacks and the diversity of plant strategies
Porteur : Nicolas BARBIER 
2020 - 2022
ReliquesFragmentation des forets sur substrats ultramafiques en Nouvelle Calédonie
Porteurs : Philippe BIRNBAUM / Nicolas BARBIER 
2019 - 2022
Tall TreesA 3D perspective on the effects of topography and wind on forest height and dynamics
Porteur : David COOMES (Cambridge University)  
2019 - 2023
UnderstoryAn infrastructure to explore plant diversity of the Amazonian forest understory
Porteurs : Géraldine DERROIRE (CIRAD, ECOFOG)  / Jérôme CHAVE (EDB, Toulouse)  
2020 - 2022

BADOURDINE Colette 2019 - 2022. Mapping tropical forest diversity from multi- and hyper-spectral imagery. Ecole doctorale : GAIA / Université de Montpellier. Dir : PELISSIER Raphaël / Co-dir. : VINCENT Grégoire

CLEMENT Jeanne 2021 - 2023. Prédire la vulnérabilité des espèces d’arbres au changement climatique en forêt Guyanaise via l’utilisation de modèles joints de distribution des espèces.". Ecole doctorale : GAIA / Université de Montpellier. Dir : COUTERON Pierre / Co-dir. : VIEILLEDENT Ghislain

CRUZ MALDONADO Nereyda-Nathalie 2017 - 2021. Réponses des communautés de plantes aux changements globaux entre des régions alpines tropicales et tempérées. Ecole doctorale : GAIA / Université de Montpellier. Dir : ANTHELME Fabien

EVOUNA ONDO Fidèle 2018 - 2023. Rôle du feu et l'écologie du sol dans l'évolution des savanes au Gabon. Ecole doctorale : GAIA / Université de Montpellier. Dir : COUTERON Pierre

GIRARD-TERCIEUX Camille 2019 - 2022. Rôle de la variabilité intraspécifique dans la coexistence des espèces de la forêt tropicale. Ecole doctorale : GAIA / Université de Montpellier. Dir : PELISSIER Raphaël

KACAMAK Asli Begum 2020 - 2023. Stratégies écologiques des lianes africaines en milieu stable et perturbé : des modèles bio-inspirants pour la robotique douce.. Ecole doctorale : GAIA / Université de Montpellier. Dir : ROWE Nicholas / Co-dir. : ROSSI Vivien

KREBBER Daniela 2019 - 2022. Comment la biodiversité influence-t-elle la réponse des forêts tropicales aux changements climatiques et aux perturbations anthropiques ?. Ecole doctorale : GAIA / Université de Guyane. Dir : MARCON Eric

Thèses

2020

Thèse

auteur
Dimitri Justeau-Allaire
titre
Constraint-based systematic conservation planning, a generic and expressive approach. Application to decision support in the conservation of New Caledonian forests.
article
Biodiversity and Ecology. Université de Montpellier, 2020. English
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Articles

Publications HAL de la collection AMAP

2021

Article dans une revue

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Stéphanie Bodin, Thomas Feiss, Jean-François Molino, Laurent Bremond. Assessment of the efficiency of three sampling methods for the recovery of soil charcoals in tropical anthropogenic sites. Quaternary International, Elsevier, In press, pp.1-24. ⟨10.1016/j.quaint.2021.04.023⟩. ⟨hal-03208693⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03208693/file/preprint_Bodin_etal2021bQUATINT.pdf BibTex
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Louise Brousseau, Paul V.A. Fine, Erwin Dreyer, Giovanni Vendramin, Ivan Scotti. Genomic and phenotypic divergence unveil microgeographic adaptation in the Amazonian hyperdominant tree Eperua falcata Aubl. (Fabaceae). Molecular Ecology, Wiley, 2021, 30 (5), pp.1136-1154. ⟨10.1111/mec.15595⟩. ⟨hal-02930429⟩
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Dimitri Justeau-Allaire, Ghislain Vieilledent, Nicolas Rinck, Philippe Vismara, Xavier Lorca, et al.. Constrained optimization of landscape indices in conservation planning to support ecological restoration in New Caledonia. Journal of Applied Ecology, Wiley, 2021, 58 (4), pp.744-754. ⟨10.1111/1365-2664.13803⟩. ⟨hal-03030515⟩
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https://hal-mines-albi.archives-ouvertes.fr/hal-03030515/file/Constrained%20optimization%20of%20landscape%20indices%20in%20conservation%20planning%20to%20support%20ecological%20restoration%20in%20New%20Caledonia_compressed.pdf BibTex
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Grace Jopaul Loubota Panzou, Adeline Fayolle, Tommaso Jucker, Oliver Phillips, Stephanie Bohlman, et al.. Pantropical variability in tree crown allometry. Global Ecology and Biogeography, Wiley, 2021, 30 (2), pp.459-475. ⟨10.1111/geb.13231⟩. ⟨hal-03103872⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03103872/file/Loubota_panzou_etal_Gloabal_Ecol_Biogeog.pdf BibTex
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Isabelle Maréchaux, Fanny Langerwisch, Andreas Huth, Harald Bugmann, Xavier Morin, et al.. Tackling unresolved questions in forest ecology: The past and future role of simulation models. Ecology and Evolution, Wiley Open Access, 2021, 11 (9), pp.3746-3770. ⟨10.1002/ece3.7391⟩. ⟨hal-03222436⟩
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M. Réjou-Méchain, Frédéric Mortier, Jean-François Bastin, Guillaume Cornu, Nicolas Barbier, et al.. Unveiling African rainforest composition and vulnerability to global change. Nature, Nature Publishing Group, In press, ⟨10.1038/s41586-021-03483-6⟩. ⟨hal-03205277⟩
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Mario Tagliari, Carolina Levis, Bernardo Flores, Graziela Blanco, Carolina Freitas, et al.. Collaborative management as a way to enhance Araucaria Forest resilience. Perspectives in Ecology and Conservation, In press, ⟨10.1016/j.pecon.2021.03.002⟩. ⟨hal-03191988⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03191988/file/Tagliari_etal_Perspectives_Ecol_Conservation_2021.pdf BibTex
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C. Vancutsem, F Achard, J.-F. Pekel, Ghislain Vieilledent, S. Carboni, et al.. Long-term (1990-2019) monitoring of forest cover changes in the humid tropics. Science Advances , American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2021, 7 (10), ⟨10.1126/sciadv.abe1603⟩. ⟨hal-03163130⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03163130/file/Vancutsem_etal_Science_Advances_2021_7_10.pdf BibTex
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Ghislain Vieilledent. forestatrisk: a Python package for modelling and forecasting deforestation in the tropics. Journal of Open Source Software, Open Journals, 2021, 6 (59), pp.2975. ⟨10.21105/joss.02975⟩. ⟨hal-03162430v2⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-03162430/file/Vieilledent2021a-JOSS.pdf BibTex

2020

Article dans une revue

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Grégoire Blanchard, Philippe Birnbaum, François Munoz. Extinction–immigration dynamics lag behind environmental filtering in shaping the composition of tropical dry forests within a changing landscape. Ecography, Wiley, 2020, 43 (6), pp.869-881. ⟨10.1111/ecog.04870⟩. ⟨hal-02512987⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02512987/file/Birnbaum_etal_Ecography_2020.pdf BibTex
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Stéphanie Bodin, Jean-François Molino, Guillaume Odonne, Laurent Bremond. Unraveling pre-Columbian occupation patterns in the tropical forests of French Guiana using an anthracological approach. Vegetation History and Archaeobotany, Springer Verlag, 2020, 29 (5), pp.567-580. ⟨10.1007/s00334-019-00767-w⟩. ⟨hal-02441094⟩
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Jérôme Chave, Camille Piponiot, Isabelle Maréchaux, Hubert de Foresta, Denis Larpin, et al.. Slow rate of secondary forest carbon accumulation in the Guianas compared with the rest of the Neotropics. Ecological Applications, Ecological Society of America, 2020, 30 (1), pp.e02004. ⟨10.1002/eap.2004⟩. ⟨hal-02309463⟩
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Léo-Paul Dagallier, Steven Janssens, Gilles Dauby, Anne Blach-Overgaard, Barbara Mackinder, et al.. Cradles and museums of generic plant diversity across tropical Africa. New Phytologist, Wiley, 2020, 225 (5), pp.2196-2213. ⟨10.1111/nph.16293⟩. ⟨hal-02407084⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02407084/file/Dauby_etal_New_Phytol_2019.pdf BibTex
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Boris Demenou, Jérémy Migliore, Myriam Heuertz, Franck Monthe, Dario Ojeda, et al.. Plastome phylogeography in two African rain forest legume trees reveals that Dahomey Gap populations originate from the Cameroon volcanic line. Molecular Phylogenetics and Evolution, Elsevier, 2020, 150, pp.1-12. ⟨10.1016/j.ympev.2020.106854⟩. ⟨hal-02893119⟩
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Adriane Esquivel-Muelbert, Oliver Phillips, Roel Brienen, Sophie Fauset, Martin Sullivan, et al.. Tree mode of death and mortality risk factors across Amazon forests. Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 11 (1), ⟨10.1038/s41467-020-18996-3⟩. ⟨hal-03005990⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03005990/file/esquivel-Muelbert_etal_Nature_Communications_2020_11.pdf BibTex
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Claire Fortunel, Clement Stahl, Patrick Heuret, Eric Nicolini, Christopher Baraloto. Disentangling the effects of environment and ontogeny on tree functional dimensions for congeneric species in tropical forests. New Phytologist, Wiley, 2020, 226 (2), pp.385-395. ⟨10.1111/nph.16393⟩. ⟨hal-02448421⟩
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C. Grinand, Ghislain Vieilledent, T. Razafimbelo, J.R. Rakotoarijaona, M. Nourtier, et al.. Landscape‐scale spatial modelling of deforestation, land degradation and regeneration using machine learning tools. Land Degradation and Development, Wiley, 2020, 31 (13), pp.1699-1712. ⟨10.1002/ldr.3526⟩. ⟨hal-02443462⟩
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Myriam Heuertz, Henri Caron, Caroline Scotti-Saintagne, Pascal Petronelli, Julien Engel, et al.. The hyperdominant tropical tree Eschweilera coriacea (Lecythidaceae) shows higher genetic heterogeneity than sympatric Eschweilera species in French Guiana. Plant Ecology and Evolution, Botanic Garden Meise and Royal Botanical Society of Belgium, 2020, 153 (1), pp.67-81. ⟨10.5091/plecevo.2020.1565⟩. ⟨hal-02536332⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02536332/file/Sabatier_etal_Plant_Ecol_Evol_2020_153_1.pdf BibTex
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Thomas Ibanez, Gunnar Keppel, Cléudia Baider, Chris Birkinshaw, F.B. Vincent Florens, et al.. Tropical cyclones and island area shape species abundance distributions of local tree communities. Oikos, Nordic Ecological Society, In press, 129 (12), pp.1856-1866. ⟨10.1111/oik.07501⟩. ⟨hal-02965358⟩
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John Katembo, Moses Libalah, Faustin Boyemba, Gilles Dauby, Nicolas Barbier. Multiple Stable Dominance States in the Congo Basin Forests. Forests, MDPI, 2020, 11 (5), pp.553. ⟨10.3390/f11050553⟩. ⟨hal-02586110⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02586110/file/Katembo_etal_Forests_2020_11_5.pdf BibTex
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Anthony Laybros, Mélaine Aubry-Kientz, Jean-Baptiste Feret, Caroline Bedeau, Olivier Brunaux, et al.. Quantitative Airborne Inventories in Dense Tropical Forest Using Imaging Spectroscopy. Remote Sensing, MDPI, 2020, 12 (10), pp.1577. ⟨10.3390/rs12101577⟩. ⟨hal-02618684⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02618684/file/Laybros_etal_Remote_Sensing_2020_12_10.pdf BibTex
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Isabelle Maréchaux, Laurent Saint‐andré, Megan Bartlett, Lawren Sack, Jerome Chave. Leaf drought tolerance cannot be inferred from classic leaf traits in a tropical rainforest. Journal of Ecology, Wiley, 2020, 108 (3), pp.1030-1045. ⟨10.1111/1365-2745.13321⟩. ⟨hal-02394283⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02394283/file/Mar-chaux_et_al-2019-Journal_of_Ecology-1.pdf BibTex
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Anand Osuri, Siddarth Machado, Jayashree Ratnam, Mahesh Sankaran, N. Ayyappan, et al.. Tree diversity and carbon storage cobenefits in tropical human-dominated landscapes. Conservation Letters, Wiley, 2020, 13 (2), pp.e12699. ⟨10.1111/conl.12699⟩. ⟨hal-02443335⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02443335/file/Osuri_et_al-2020-Conservation_Letters.pdf BibTex
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Robin Pouteau, Santiago Trueba, Sandrine Isnard. Retracing the contours of the early angiosperm environmental niche. Annals of Botany, Oxford University Press (OUP), 2020, 125 (1), pp.49-57. ⟨10.1093/aob/mcz131⟩. ⟨hal-02277290⟩
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Kaina Privet, Vincent Vedel, Claire Fortunel, Jérôme Orivel, Quentin Martinez, et al.. Relative Efficiency of Pitfall Trapping vs. Nocturnal Hand Collecting in Assessing Soil-Dwelling Spider Diversity along A Structural Gradient of Neotropical Habitats. Diversity, MDPI, 2020, 12 (2), pp.81. ⟨10.3390/d12020081⟩. ⟨hal-02529839⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02529839/file/Fortunel_et%20al_Diversity_2020_12_2.pdf BibTex
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Heidy Schimann, Jason Vleminckx, Christopher Baraloto, Julien Engel, Gaëlle Jaouen, et al.. Tree communities and soil properties influence fungal community assembly in neotropical forests. Biotropica, Wiley, 2020, 52 (3), pp.444-456. ⟨10.1111/btp.12747⟩. ⟨hal-02502383⟩
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Sylvain Schmitt, Isabelle Maréchaux, Jérôme Chave, Fabian Jörg Fischer, Camille Piponiot, et al.. Functional diversity improves tropical forest resilience: Insights from a long‐term virtual experiment. Journal of Ecology, Wiley, 2020, 108 (3), pp.831-841. ⟨10.1111/1365-2745.13320⟩. ⟨hal-02394908⟩
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https://hal.umontpellier.fr/hal-02394908/file/Schmitt_et_al-2019-Journal_of_Ecology_V2.pdf BibTex
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Martin Sullivan, Simon Lewis, Kofi Affum-Baffoe, Carolina Castilho, Flávia Costa, et al.. Long-term thermal sensitivity of Earth’s tropical forests. Science, American Association for the Advancement of Science, 2020, 368 (6493), pp.869-874. ⟨10.1126/science.aaw7578⟩. ⟨hal-02650649⟩
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Hans ter Steege, Paulo Prado, Renato de Lima, Edwin Pos, Diogenes de Andrade, et al.. Biased-corrected richness estimates for the Amazonian tree flora. Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2020, 10, pp.10130. ⟨10.1038/s41598-020-66686-3⟩. ⟨hal-02883980⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02883980/file/TerSteege_etal_Scientific_Reports_2020_10.pdf BibTex
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Niklas Tysklind, Marie-Pierre Etienne, Caroline Scotti-Saintagne, Alexandra Tinaut, Maxime Casalis, et al.. Microgeographic local adaptation and ecotype distributions: The role of selective processes on early life‐history traits in sympatric, ecologically divergent Symphonia populations. Ecology and Evolution, Wiley Open Access, 2020, 10 (19), pp.10735-10753. ⟨10.1002/ece3.6731⟩. ⟨hal-02948828⟩
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02948828/file/hal-02948828.pdf BibTex
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Boniface Tientcheu Yogom, Marie-Louise Avana-Tientcheu, Marcelle Franca Meguem Mboujda, Stephane Momo Takoudjou, Théophile Fonkou, et al.. Ethnicity Differences in Uses and Management Practices of Bitter Kola Trees (Garcinia kola) in Cameroon. Economic Botany, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s12231-020-09508-x⟩. ⟨hal-03011883⟩
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Jenny Zembrano, Norbert J. Codeiro, Carol Garzon-Lopez, Lauren Yeager, Claire Fortunel, et al.. Investigating the direct and indirect effects of forest fragmentation on plant functional diversity. PLoS ONE, Public Library of Science, 2020, 15 (7), pp.e0235210. ⟨10.1371/journal.pone.0235210⟩. ⟨hal-02929062⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-02929062/file/Zambro_etal_Plos_One_2020_15_7_e0235210.pdf BibTex