L'UMR AMAP est une Unité Mixte de Recherche à 5 tutelles, rattachée :

•  au département Systèmes Biologiques (BIOS) du CIRAD (UR 51)
•  à l'Institut Ecologie et Environnement (INEE) du CNRS (UMR 5120)
•  au Département Ecologie et Biodiversité (ECODIV) de l'INRAE (UMR 931)
•  au Département Ecologie, Biodiversité et Fonctionnement des Ecosystèmes Continentaux (ECOBIO) de l'IRD (UMR 123)
•  au Département Biologie-Ecologie-Evolution-Environnement-Sciences de la Terre et de l'Eau (B3ESTE) de la faculté des Sciences de l'Université Montpellier