AMAPinfos 61 (Janvier - Juin)

Vie scientifique

La phylogénomique et l’essor des angiospermes

L’arbre de vie des angiospermes a longtemps été principalement réalisé à l’aide d’analyses du génome chloroplastique, sur un échantillonnage limité, et la fiabilité de cet arbre était mise en doute. Un nouvel arbre a été produit à partir de 8 000 genres (~60 %), et de génomes normalisés de 353 gènes nucléaires. Cette multiplication par 15 de l’échantillonnage générique par rapport à des études nucléaires comparables permet de tester des résultats antérieurs et apporte des changements notables à des groupes clés, en particulier chez les rosides, tout en corroborant de nombreuses relations prédites précédemment. La calibration à l’aide de 200 fossiles a permis de voir que l’évolution des premières angiospermes était caractérisée par un conflit élevé entre les arbres génétiques et une diversification explosive, donnant naissance à plus de 80 % des ordres d’angiospermes existants. Une diversification régulière a suivi pendant le reste de l’ère mésozoïque jusqu’à ce que les taux réapparaissent à l’ère cénozoïque, en même temps que la baisse des températures mondiales et en lien étroit avec les conflits d’arbres génétiques.

Référence :
Zuntini A. R., et al., 2024. Phylogenomics and the rise of the angiosperms. Nature, 629: 843-850. (https://doi.org/10.1038/s41586-024-07324-0)

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Arbre phylogénétique calibré dans le temps pour les angiospermes, basé sur 353 gènes nucléaires. (in : Rizzo Zuntini, A., & Carruthers, T. , 2024. Phylogenomics and the rise of the angiosperms [Data set]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.10778207