AXE Modélisation du monde végétal

Objectif

Développer des méthodes et outils pour l’étude et la modélisation des systèmes complexes issus du monde végétal.

Approche

Nos travaux s’appuient sur des compétences en bases de données, en analyse d’images, en génie logiciel, en mathématiques appliquées, et en modélisation. Cette diversité des compétences permet de développer des outils et méthodes originales non seulement pour l’acquisition de connaissances, l’étude et l’analyse de données, mais également pour la représentation ou la description de processus biologiques complexes du monde végétal à l’aide de formalismes mathématiques et d’outils informatiques dédiés. Les défis à relever sont nombreux, comme (i) la prise en compte de différentes échelles spatiales et temporelles dans les modèles en fonction de la question biologique initiale, (ii) l’analyse et la simulation de modèles multi-échelles qui représente un enjeu capital pour fournir des outils d’aide à la décision notamment pour l’étude des scenarii de perturbation (activités humaines, changement climatique, etc.), (iii) la représentation et la caractérisation des structures d'intérêt (par analyse d'images...) et (iv) l’acquisition, la gestion et l’analyse de données massives.
C’est pourquoi, bien que nos travaux s’inscrivent naturellement dans le cadre de collaborations étroites avec les biologistes des plantes, les agronomes, les forestiers et les écologues, notre objectif est également de développer des recherches originales dans les domaines des mathématiques appliquées et de l’informatique.

Résultats attendus

(i) développer des modèles, des méthodes et des outils pour comprendre le développement et la croissance des plantes (de l’organe à la population), les interactions plantes-environnement et le fonctionnement des écosystèmes ; (ii) fournir des outils d’acquisition, de gestion et d’analyse de données ; (iii) fournir des outils pour évaluer/prédire/optimiser les services rendus (indicateurs, outils d’aide à l’identification, d’aide à la décision, etc.), (iv) aider à la conception d’expérimentations/observations pour valider/invalider les modèles.

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