Software product
This section if avalaible only in French.
Computer programmes and software developed at AMAP
 | AMAPSim | AMAPsim propose un noyau de simulation du développement architectural d'une plante interconnectable avec des applications externes. |
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| Capsis | Capsis est une plate-forme de développement de modèles de croissance et de dynamique forestière. Il permet de construire et d'évaluer des scénarios sylvicoles en s'appuyant sur un modèle pour une espèce et une région donnée (fertilité stationnelle, densité initiale, intensité, type et nature des éclaircies, élagage...). Il est utilisé par des chercheurs pour évaluer leurs modèles, des gestionnaires forestiers pour aider à l'élaboration de guides sylvicoles et pour l'enseignement. |
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| Diogene | Diogène permet une analyse biométrique intégrée d’observations sur plantes annuelles ou pérennes (plantations comparatives ou populations naturelles) à travers des modèles multivariables non-orthogonaux. Le logiciel traite également, séparément ou conjointement, les analyses de marqueurs moléculaires (architecture GLM). Cette propriété s'étend plus généralement à des variables qualitatives (par exemple, type architectural) et quantitatives (mesures). Sorties graphiques en qualité publication, par interfaçage avec Gnuplot. Puissants sous-ensembles de Statistiques Spatiales et d'Analyse des Données avec dendrogrammes associés (7 algorithmes d'agglomération). Mécanisme de rééchantillonnage (jackknife et bootstrap), totalement automatisé et très rapide. Diogène peut traiter simultanément jusqu'à 9999 variables, librement définissables par l'utilisateur via un analyseur syntaxique. |
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| IDAO | IDentification des plantes Assistée par Ordinateur est un procédé utilisant un système de portrait robot, qui permet l'identification de plantes (arbres, adventices, pollens...) même jeunes ou incomplètes, pour des utilisateurs, spécialistes ou non de la botanique. |
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| MHM (for Multiscale Heterogeneity Map) | MHM, for Multiscale Heterogeneity Map, is a convenient tool aiming at analysing almost every kind of surface patterns. It focuses on a multiscale analysis and offers multiscale maps and profiles of the mostly used pattern indices. This method is summarized within a coherent opensource software that makes analyses very friendly for ecological, remote sensing and even biological or physical studies. MHM is fully complementary to geostatistical tools (dedicated to point-pattern analyses) or to Fragstats modules (generally offering monoscale analyses) and focuses on patchy mosaics. MHM software has been developed from Gaucherel’s Matlab® routines (see references) and has been recently transformed into an open Java® multiplatform software (see developer forum). MHM works with images saved in raster mode and deliverates quantified indices in similar and different formats.
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| Pl@ntNote | L'application Pl@ntNote est un logiciel libre destiné au chercheur pour une gestion locale de ses données écologiques collectées sur le terrain. C'est un outil modulable basé sur les individus-plantes. |
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Applications libres
AMAPGRR
AMAPGRR est une application PHP/MySql sous licence GPL, adaptée de GRR (Gestion et Réservation de Ressources) - Version GRR 1.9.4c.Cette application est dédiée à la gestion et à la réservation de ressources collectives d'une unité ou d'un laboratoire de recherche : matériels de préparation d’échantillon, matériels de mesure, matériels de projection, ordinateurs collectifs, véhicule de service, salle de réunion. Cette adaptation est également sous licence GPL, libre et gratuite.
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